Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms