Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms