Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PDZK1Q5T2W1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDZK1Q5T2W1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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