Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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CNGA3Q16281 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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CNGA3Q16281 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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CNGA3Q16281 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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CNGA3Q16281 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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CNGA3Q16281 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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