Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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EFNB3Q15768 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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EFNB3Q15768 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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EFNB3Q15768 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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EFNB3Q15768 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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EFNB3Q15768 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFNB3Q15768 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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