Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIM29Q14134 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms