Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms