Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC4A3P48751 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms