Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTX3P26022 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTX3P26022 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTX3P26022 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTX3P26022 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTX3P26022 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms