Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH2P19022 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH2P19022 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH2P19022 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH2P19022 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH2P19022 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH2P19022 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms