Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms