Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms