Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX4O95219 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX4O95219 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX4O95219 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX4O95219 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX4O95219 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX4O95219 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX4O95219 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX4O95219 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX4O95219 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX4O95219 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX4O95219 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX4O95219 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX4O95219 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX4O95219 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX4O95219 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms