Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNJ2O15056 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNJ2O15056 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms