Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms