Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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RABGEF1Q9UJ41 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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RABGEF1Q9UJ41 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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RABGEF1Q9UJ41 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RABGEF1Q9UJ41 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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