Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms