Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2AFVQ71UI9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms