Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP43Q70EL4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP43Q70EL4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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