Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HACD2Q6Y1H2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms