Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMARCD3Q6STE5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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