Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRAMD4Q6IC98 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms