Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP40Q5TG30 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARHGAP40Q5TG30 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARHGAP40Q5TG30 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms