Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
MTMR3Q13615 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTMR3Q13615 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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