Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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TOP3AQ13472 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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TOP3AQ13472 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TOP3AQ13472 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TOP3AQ13472 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TOP3AQ13472 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TOP3AQ13472 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TOP3AQ13472 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TOP3AQ13472 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TOP3AQ13472 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TOP3AQ13472 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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