Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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RAB40BQ12829 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB40BQ12829 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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