Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms