Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
IRF8Q02556 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF8Q02556 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms