Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA5Q01523 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA5Q01523 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms