Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RELBQ01201 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RELBQ01201 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms