Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms