Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERVK_113P62684 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P62684 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms