Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVFC1P60507 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVFC1P60507 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms