Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSCP56915 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSCP56915 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSCP56915 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSCP56915 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSCP56915 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSCP56915 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSCP56915 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSCP56915 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSCP56915 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSCP56915 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSCP56915 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSCP56915 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GSCP56915 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GSCP56915 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GSCP56915 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GSCP56915 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms