Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BGRP55822 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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