Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NESP48681 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NESP48681 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NESP48681 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NESP48681 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NESP48681 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NESP48681 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
NESP48681 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NESP48681 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NESP48681 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NESP48681 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NESP48681 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NESP48681 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NESP48681 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NESP48681 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NESP48681 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NESP48681 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NESP48681 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NESP48681 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NESP48681 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NESP48681 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NESP48681 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NESP48681 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NESP48681 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NESP48681 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NESP48681 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NESP48681 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NESP48681 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NESP48681 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NESP48681 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NESP48681 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NESP48681 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NESP48681 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NESP48681 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NESP48681 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NESP48681 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NESP48681 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NESP48681 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms