Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PI4KAP42356 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PI4KAP42356 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms