Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PCSK1P29120 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms