Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA1P23193 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms