Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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