Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CFAP73A6NFT4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CFAP73A6NFT4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CFAP73A6NFT4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CFAP73A6NFT4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CFAP73A6NFT4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CFAP73A6NFT4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CFAP73A6NFT4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CFAP73A6NFT4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CFAP73A6NFT4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CFAP73A6NFT4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CFAP73A6NFT4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFAP73A6NFT4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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