Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms