Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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