Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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