Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL20Q9Y2M5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL20Q9Y2M5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms