Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms