Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms