Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM6Q9NX76 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms