Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATAD3AQ9NVI7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms