Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5RAP3Q96JB5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms